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組織普魯士藍染色是非常經典的組織化學反應，是顯示組織內三價鐵的一種敏感、傳統優良的方法，其染色原理為：三價鐵離子從蛋白質中被稀鹽酸分離出來，生成不溶解的藍色化合物，即普魯士藍。

酸性磷酸酶（Acid Phosphatase, ACP）染色是一種細胞化學染色技術，用于檢測組織或細胞中酸性磷酸酶的活性。酸性磷酸酶是一種在酸性環境中活躍的水解酶，廣泛分布于人體多種組織和細胞類型中，尤其是溶酶體。ACP染色在病理學和臨床診斷中非常有用，例如在血液病的診斷、腫瘤的鑒別診斷以及某些代謝性疾病的研究中。

NAP染色實驗：堿性磷酸酶染色（NAP）在臨床的應用基本屬于常規篩查的染色法；專門用于血液或骨髓細胞涂片的中性粒細胞的堿性磷酸酶染色，又稱同時偶聯法。堿性磷酸酶活性部位呈藍色，位于胞漿中。油鏡下計數101個中性粒細胞，求出百分比和積分。非特異性反應少，結果可靠。

組織甲苯胺藍染色：該染色能夠清楚地顯示軟骨形態潮線等結構，觀察軟骨組織是否有損傷，軟骨呈鮮艷的紫色 （紫紅色）， 其他為淺藍色。

軟骨染色：番紅-固綠染色（軟骨）在涉及關節軟骨及軟骨下骨的形態學研究中，常需要聯合使用多種染料以顯示其組織學結構。其中，起源于上世紀60年代的番紅O-固綠染色因可以直觀反映關節軟骨、軟骨下骨和骨組織的結構而備受青睞。

小動物脂肪染色：油紅O為脂溶性染料，在脂肪內能高度溶解，可特異性的使組織內甘油三酯等中性脂肪著色，油紅O脂肪染色法指在日常病理診斷和科研工作中為了顯示組織內的脂肪常采用油紅O進行染色的方法。